基準日がカード登録日だった場合

月次の継続決済で、基準日を「初回決済日と同じ」にした場合、カード登録の日から継続決済がはじまりますか?

いいえ。
基準日は本日以降の日付となりますので、月次の継続決済で基準日を「初回決済と同じ」にした場合、次月の初回決済と同じ日にちが初回の継続決済日となります。