下記をご確認ください。
・ブラウザの設定でJavascriptを使用しない設定になっていないか
・ブラウザの設定でポップアップをブロックにする設定になっていないか
・HTMLボタンを設置しようとしているサイトで、他にJavascriptを使用していて内容が干渉し合っていないか